Основные группы бактерий, обитающих в толстой кишке здорового человека

Желудочно-кишечный тракт человека и животных является естественной средой обитания микроорганизмов. Особенно их много в нижнем отделе толстой кишки. Число микроорганизмов в толстой кишке позвоночных составляет 10¹⁰–10¹¹ на 1 г кишечного содержимого.

В тонкой кишке их значительно меньше благодаря бактерицидности желудочного сока, перистальтике и, вероятно, эндогенным антимикробным факторам тонкой кишки, хотя может достигать у человека 10⁸. В верхнем и среднем отделах тонкой кишки есть только небольшие популяции: грамположительные факультативные аэробы, небольшое количество анаэробов, дрожжей и грибов. В дистальных отделах тонкой кишки (в области илеоцекальной заслонки) состав ''микробного спектра'' занимает промежуточное положение между микрофлорой проксимальных отделов тонкой и толстой кишки. Нижняя часть подвздошной кишки заселена такими же микроорганизмами, что и толстая кишка, хотя в меньшем количестве.

Более доступна исследованию микрофлора фекалий, которая фактически является флорой дистального отдела толстой кишки. В фекалиях при микроскопии обнаруживают множество бактериальных клеток, из которых примерно 10% может размножаться на искусственных питательных средах.